Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CltcQ68FD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CltcQ68FD5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CltcQ68FD5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms