Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rab3ipQ68EF0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab3ipQ68EF0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms