Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sbno1Q689Z5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sbno1Q689Z5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sbno1Q689Z5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms