Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp4eQ66X19 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nlrp4eQ66X19 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrp4eQ66X19 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrp4eQ66X19 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrp4eQ66X19 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrp4eQ66X19 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nlrp4eQ66X19 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nlrp4eQ66X19 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nlrp4eQ66X19 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp4eQ66X19 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp4eQ66X19 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp4eQ66X19 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nlrp4eQ66X19 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms