Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrmQ64674 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrmQ64674 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms