Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2a3Q64518 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp2a3Q64518 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms