Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PtprdQ64487 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PtprdQ64487 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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PtprdQ64487 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtprdQ64487 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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PtprdQ64487 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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PtprdQ64487 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprdQ64487 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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