Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Surf4Q64310 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms