Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
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Ccdc18Q640L5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc18Q640L5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
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Ccdc18Q640L5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
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Ccdc18Q640L5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc18Q640L5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
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