Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SypQ62277 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SypQ62277 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SypQ62277 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SypQ62277 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SypQ62277 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SypQ62277 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms