Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb1i1Q62219 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb1i1Q62219 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms