Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SnrpaQ62189 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SnrpaQ62189 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms