Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga6Q61739 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga6Q61739 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga6Q61739 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms