Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gli3Q61602 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gli3Q61602 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gli3Q61602 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms