Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp7Q60973 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp7Q60973 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms