Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm2aQ60648 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm2aQ60648 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms