Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Tdrd5Q5VCS6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tdrd5Q5VCS6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tdrd5Q5VCS6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Tdrd5Q5VCS6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tdrd5Q5VCS6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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