Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tnfsf15Q5UBV8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms