Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdcp1Q5U462 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdcp1Q5U462 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms