Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dnajc11Q5U458 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dnajc11Q5U458 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms