Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim38Q5SZ99 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trim38Q5SZ99 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim38Q5SZ99 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim38Q5SZ99 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trim38Q5SZ99 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Trim38Q5SZ99 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Trim38Q5SZ99 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Trim38Q5SZ99 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Trim38Q5SZ99 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim38Q5SZ99 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Trim38Q5SZ99 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trim38Q5SZ99 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Trim38Q5SZ99 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Trim38Q5SZ99 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim38Q5SZ99 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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