Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf215Q5SPX3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnf215Q5SPX3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms