Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trav8d-2Q5R1B6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trav8d-2Q5R1B6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms