Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1810065E05RikQ5NC41 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms