Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vps41Q5KU39 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vps41Q5KU39 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms