Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnni3kQ5GIG6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3kQ5GIG6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnni3kQ5GIG6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnni3kQ5GIG6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3kQ5GIG6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3kQ5GIG6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms