Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xkr9Q5GH62 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Xkr9Q5GH62 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms