Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q5EBG8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q5EBG8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q5EBG8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms