Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrc3Q5DU56 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms