Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt2Q5DTW2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms