Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Znf608Q56A10 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Znf608Q56A10 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf608Q56A10 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf608Q56A10 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Znf608Q56A10 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Znf608Q56A10 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms