Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Eme2Q56A04 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Eme2Q56A04 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms