Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krt35Q497I4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krt35Q497I4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms