Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
6430531B16RikQ3V2J1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms