Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc110Q3V125 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc110Q3V125 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms