Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3V0E1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3V0E1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms