Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933416C03RikQ3V063 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933416C03RikQ3V063 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4933416C03RikQ3V063 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4933416C03RikQ3V063 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933416C03RikQ3V063 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms