Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hipk4Q3V016 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms