Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
E330034G19RikQ3UWX6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E330034G19RikQ3UWX6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms