Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Skap1Q3UUV5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Skap1Q3UUV5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms