Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syndig1lQ3USQ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms