Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Klhdc9Q3USL1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhdc9Q3USL1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms