Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf48Q3US17 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Znf48Q3US17 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms