Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc190Q3URK1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc190Q3URK1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms