Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Shisa3Q3UPR0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Shisa3Q3UPR0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms