Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Skap2Q3UND0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms