Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Smu1Q3UKJ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smu1Q3UKJ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms