Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp19Q3UJD6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp19Q3UJD6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp19Q3UJD6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms