Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnft2Q3UF64 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms