Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ttll12Q3UDE2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ttll12Q3UDE2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms